Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS9D1Q9Y2B5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS9D1Q9Y2B5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS9D1Q9Y2B5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS9D1Q9Y2B5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS9D1Q9Y2B5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS9D1Q9Y2B5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS9D1Q9Y2B5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS9D1Q9Y2B5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS9D1Q9Y2B5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VPS9D1Q9Y2B5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS9D1Q9Y2B5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS9D1Q9Y2B5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS9D1Q9Y2B5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS9D1Q9Y2B5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS9D1Q9Y2B5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS9D1Q9Y2B5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS9D1Q9Y2B5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS9D1Q9Y2B5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS9D1Q9Y2B5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS9D1Q9Y2B5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS9D1Q9Y2B5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS9D1Q9Y2B5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS9D1Q9Y2B5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS9D1Q9Y2B5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS9D1Q9Y2B5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS9D1Q9Y2B5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS9D1Q9Y2B5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS9D1Q9Y2B5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS9D1Q9Y2B5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS9D1Q9Y2B5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS9D1Q9Y2B5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS9D1Q9Y2B5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS9D1Q9Y2B5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS9D1Q9Y2B5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS9D1Q9Y2B5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS9D1Q9Y2B5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS9D1Q9Y2B5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS9D1Q9Y2B5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS9D1Q9Y2B5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS9D1Q9Y2B5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS9D1Q9Y2B5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS9D1Q9Y2B5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS9D1Q9Y2B5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS9D1Q9Y2B5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS9D1Q9Y2B5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS9D1Q9Y2B5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS9D1Q9Y2B5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS9D1Q9Y2B5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS9D1Q9Y2B5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS9D1Q9Y2B5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS9D1Q9Y2B5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS9D1Q9Y2B5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS9D1Q9Y2B5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS9D1Q9Y2B5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS9D1Q9Y2B5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms