Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y294

ASF1A, Histone chaperone ASF1A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1AQ9Y294 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASF1AQ9Y294 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASF1AQ9Y294 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASF1AQ9Y294 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASF1AQ9Y294 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASF1AQ9Y294 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASF1AQ9Y294 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASF1AQ9Y294 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASF1AQ9Y294 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASF1AQ9Y294 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASF1AQ9Y294 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASF1AQ9Y294 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASF1AQ9Y294 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASF1AQ9Y294 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASF1AQ9Y294 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASF1AQ9Y294 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASF1AQ9Y294 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASF1AQ9Y294 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ASF1AQ9Y294 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASF1AQ9Y294 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ASF1AQ9Y294 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ASF1AQ9Y294 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASF1AQ9Y294 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASF1AQ9Y294 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASF1AQ9Y294 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ASF1AQ9Y294 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASF1AQ9Y294 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ASF1AQ9Y294 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASF1AQ9Y294 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASF1AQ9Y294 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms