Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAF3IP3Q9Y228 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAF3IP3Q9Y228 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAF3IP3Q9Y228 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAF3IP3Q9Y228 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAF3IP3Q9Y228 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAF3IP3Q9Y228 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAF3IP3Q9Y228 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAF3IP3Q9Y228 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAF3IP3Q9Y228 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAF3IP3Q9Y228 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAF3IP3Q9Y228 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAF3IP3Q9Y228 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAF3IP3Q9Y228 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAF3IP3Q9Y228 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAF3IP3Q9Y228 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAF3IP3Q9Y228 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAF3IP3Q9Y228 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAF3IP3Q9Y228 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAF3IP3Q9Y228 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAF3IP3Q9Y228 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAF3IP3Q9Y228 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAF3IP3Q9Y228 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAF3IP3Q9Y228 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAF3IP3Q9Y228 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAF3IP3Q9Y228 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAF3IP3Q9Y228 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAF3IP3Q9Y228 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAF3IP3Q9Y228 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAF3IP3Q9Y228 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAF3IP3Q9Y228 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAF3IP3Q9Y228 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAF3IP3Q9Y228 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAF3IP3Q9Y228 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAF3IP3Q9Y228 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAF3IP3Q9Y228 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAF3IP3Q9Y228 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAF3IP3Q9Y228 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAF3IP3Q9Y228 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAF3IP3Q9Y228 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAF3IP3Q9Y228 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAF3IP3Q9Y228 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAF3IP3Q9Y228 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAF3IP3Q9Y228 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAF3IP3Q9Y228 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAF3IP3Q9Y228 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAF3IP3Q9Y228 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAF3IP3Q9Y228 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAF3IP3Q9Y228 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAF3IP3Q9Y228 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAF3IP3Q9Y228 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAF3IP3Q9Y228 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAF3IP3Q9Y228 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAF3IP3Q9Y228 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAF3IP3Q9Y228 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAF3IP3Q9Y228 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAF3IP3Q9Y228 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAF3IP3Q9Y228 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAF3IP3Q9Y228 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAF3IP3Q9Y228 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAF3IP3Q9Y228 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAF3IP3Q9Y228 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAF3IP3Q9Y228 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAF3IP3Q9Y228 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAF3IP3Q9Y228 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAF3IP3Q9Y228 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAF3IP3Q9Y228 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAF3IP3Q9Y228 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAF3IP3Q9Y228 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAF3IP3Q9Y228 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAF3IP3Q9Y228 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms