Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GNEQ9Y223 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GNEQ9Y223 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GNEQ9Y223 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GNEQ9Y223 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GNEQ9Y223 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GNEQ9Y223 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GNEQ9Y223 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GNEQ9Y223 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GNEQ9Y223 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GNEQ9Y223 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GNEQ9Y223 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GNEQ9Y223 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GNEQ9Y223 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GNEQ9Y223 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GNEQ9Y223 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GNEQ9Y223 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GNEQ9Y223 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GNEQ9Y223 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GNEQ9Y223 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GNEQ9Y223 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GNEQ9Y223 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GNEQ9Y223 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GNEQ9Y223 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GNEQ9Y223 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GNEQ9Y223 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GNEQ9Y223 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GNEQ9Y223 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GNEQ9Y223 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GNEQ9Y223 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GNEQ9Y223 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GNEQ9Y223 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GNEQ9Y223 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GNEQ9Y223 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GNEQ9Y223 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GNEQ9Y223 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GNEQ9Y223 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GNEQ9Y223 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GNEQ9Y223 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GNEQ9Y223 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GNEQ9Y223 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GNEQ9Y223 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GNEQ9Y223 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GNEQ9Y223 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GNEQ9Y223 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GNEQ9Y223 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GNEQ9Y223 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GNEQ9Y223 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GNEQ9Y223 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GNEQ9Y223 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GNEQ9Y223 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GNEQ9Y223 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GNEQ9Y223 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GNEQ9Y223 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GNEQ9Y223 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GNEQ9Y223 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GNEQ9Y223 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GNEQ9Y223 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GNEQ9Y223 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNEQ9Y223 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNEQ9Y223 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNEQ9Y223 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNEQ9Y223 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNEQ9Y223 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GNEQ9Y223 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GNEQ9Y223 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GNEQ9Y223 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GNEQ9Y223 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GNEQ9Y223 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GNEQ9Y223 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GNEQ9Y223 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GNEQ9Y223 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GNEQ9Y223 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GNEQ9Y223 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GNEQ9Y223 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GNEQ9Y223 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms