Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN8AQ9UQD0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN8AQ9UQD0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN8AQ9UQD0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN8AQ9UQD0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN8AQ9UQD0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN8AQ9UQD0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN8AQ9UQD0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN8AQ9UQD0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN8AQ9UQD0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN8AQ9UQD0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN8AQ9UQD0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN8AQ9UQD0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN8AQ9UQD0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN8AQ9UQD0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN8AQ9UQD0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN8AQ9UQD0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN8AQ9UQD0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN8AQ9UQD0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms