Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAPRE3Q9UPY8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAPRE3Q9UPY8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAPRE3Q9UPY8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAPRE3Q9UPY8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAPRE3Q9UPY8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAPRE3Q9UPY8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAPRE3Q9UPY8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAPRE3Q9UPY8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAPRE3Q9UPY8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAPRE3Q9UPY8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAPRE3Q9UPY8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MAPRE3Q9UPY8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAPRE3Q9UPY8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAPRE3Q9UPY8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAPRE3Q9UPY8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAPRE3Q9UPY8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAPRE3Q9UPY8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAPRE3Q9UPY8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAPRE3Q9UPY8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAPRE3Q9UPY8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAPRE3Q9UPY8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAPRE3Q9UPY8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAPRE3Q9UPY8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAPRE3Q9UPY8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAPRE3Q9UPY8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAPRE3Q9UPY8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAPRE3Q9UPY8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAPRE3Q9UPY8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms