Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPK3Q9UPE1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPK3Q9UPE1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPK3Q9UPE1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPK3Q9UPE1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPK3Q9UPE1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPK3Q9UPE1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPK3Q9UPE1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPK3Q9UPE1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPK3Q9UPE1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPK3Q9UPE1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPK3Q9UPE1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPK3Q9UPE1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPK3Q9UPE1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPK3Q9UPE1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPK3Q9UPE1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPK3Q9UPE1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPK3Q9UPE1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPK3Q9UPE1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPK3Q9UPE1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPK3Q9UPE1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPK3Q9UPE1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPK3Q9UPE1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPK3Q9UPE1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPK3Q9UPE1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPK3Q9UPE1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPK3Q9UPE1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPK3Q9UPE1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPK3Q9UPE1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPK3Q9UPE1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPK3Q9UPE1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPK3Q9UPE1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPK3Q9UPE1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPK3Q9UPE1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPK3Q9UPE1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRPK3Q9UPE1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRPK3Q9UPE1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms