Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A1LQ9UNN4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A1LQ9UNN4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2A1LQ9UNN4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A1LQ9UNN4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms