Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNRGQ9UMZ2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNRGQ9UMZ2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNRGQ9UMZ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNRGQ9UMZ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNRGQ9UMZ2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNRGQ9UMZ2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNRGQ9UMZ2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNRGQ9UMZ2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNRGQ9UMZ2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNRGQ9UMZ2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNRGQ9UMZ2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNRGQ9UMZ2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNRGQ9UMZ2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNRGQ9UMZ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNRGQ9UMZ2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNRGQ9UMZ2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNRGQ9UMZ2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNRGQ9UMZ2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNRGQ9UMZ2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYNRGQ9UMZ2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNRGQ9UMZ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNRGQ9UMZ2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNRGQ9UMZ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNRGQ9UMZ2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNRGQ9UMZ2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNRGQ9UMZ2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNRGQ9UMZ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNRGQ9UMZ2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNRGQ9UMZ2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNRGQ9UMZ2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNRGQ9UMZ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNRGQ9UMZ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNRGQ9UMZ2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNRGQ9UMZ2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNRGQ9UMZ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNRGQ9UMZ2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNRGQ9UMZ2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYNRGQ9UMZ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNRGQ9UMZ2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNRGQ9UMZ2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNRGQ9UMZ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNRGQ9UMZ2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNRGQ9UMZ2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNRGQ9UMZ2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNRGQ9UMZ2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNRGQ9UMZ2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNRGQ9UMZ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNRGQ9UMZ2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNRGQ9UMZ2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms