Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ALKQ9UM73 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
ALKQ9UM73 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ALKQ9UM73 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ALKQ9UM73 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
ALKQ9UM73 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ALKQ9UM73 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
ALKQ9UM73 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ALKQ9UM73 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ALKQ9UM73 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ALKQ9UM73 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ALKQ9UM73 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ALKQ9UM73 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ALKQ9UM73 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ALKQ9UM73 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ALKQ9UM73 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ALKQ9UM73 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ALKQ9UM73 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ALKQ9UM73 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
ALKQ9UM73 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
ALKQ9UM73 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ALKQ9UM73 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ALKQ9UM73 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ALKQ9UM73 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ALKQ9UM73 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ALKQ9UM73 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ALKQ9UM73 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ALKQ9UM73 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ALKQ9UM73 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ALKQ9UM73 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ALKQ9UM73 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ALKQ9UM73 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ALKQ9UM73 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ALKQ9UM73 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ALKQ9UM73 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ALKQ9UM73 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ALKQ9UM73 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ALKQ9UM73 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ALKQ9UM73 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ALKQ9UM73 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ALKQ9UM73 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ALKQ9UM73 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ALKQ9UM73 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ALKQ9UM73 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ALKQ9UM73 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ALKQ9UM73 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ALKQ9UM73 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ALKQ9UM73 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ALKQ9UM73 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
ALKQ9UM73 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
ALKQ9UM73 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ALKQ9UM73 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ALKQ9UM73 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ALKQ9UM73 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ALKQ9UM73 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
ALKQ9UM73 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
ALKQ9UM73 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
ALKQ9UM73 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ALKQ9UM73 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ALKQ9UM73 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ALKQ9UM73 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
ALKQ9UM73 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ALKQ9UM73 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ALKQ9UM73 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ALKQ9UM73 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ALKQ9UM73 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
ALKQ9UM73 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ALKQ9UM73 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ALKQ9UM73 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ALKQ9UM73 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ALKQ9UM73 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ALKQ9UM73 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ALKQ9UM73 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ALKQ9UM73 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ALKQ9UM73 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ALKQ9UM73 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ALKQ9UM73 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ALKQ9UM73 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ALKQ9UM73 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
ALKQ9UM73 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ALKQ9UM73 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ALKQ9UM73 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ALKQ9UM73 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ALKQ9UM73 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ALKQ9UM73 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
ALKQ9UM73 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ALKQ9UM73 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ALKQ9UM73 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ALKQ9UM73 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ALKQ9UM73 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ALKQ9UM73 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ALKQ9UM73 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ALKQ9UM73 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ALKQ9UM73 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ALKQ9UM73 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ALKQ9UM73 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ALKQ9UM73 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ALKQ9UM73 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ALKQ9UM73 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ALKQ9UM73 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms