Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK12

ZNF222, Zinc finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF222Q9UK12 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF222Q9UK12 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF222Q9UK12 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF222Q9UK12 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF222Q9UK12 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF222Q9UK12 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF222Q9UK12 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF222Q9UK12 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF222Q9UK12 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF222Q9UK12 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF222Q9UK12 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF222Q9UK12 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF222Q9UK12 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF222Q9UK12 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF222Q9UK12 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF222Q9UK12 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF222Q9UK12 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms