Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX25Q9UHL0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX25Q9UHL0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX25Q9UHL0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX25Q9UHL0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX25Q9UHL0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX25Q9UHL0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX25Q9UHL0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX25Q9UHL0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX25Q9UHL0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX25Q9UHL0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX25Q9UHL0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX25Q9UHL0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX25Q9UHL0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX25Q9UHL0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX25Q9UHL0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX25Q9UHL0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX25Q9UHL0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX25Q9UHL0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX25Q9UHL0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX25Q9UHL0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX25Q9UHL0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX25Q9UHL0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX25Q9UHL0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX25Q9UHL0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX25Q9UHL0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX25Q9UHL0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX25Q9UHL0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX25Q9UHL0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX25Q9UHL0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX25Q9UHL0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX25Q9UHL0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX25Q9UHL0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX25Q9UHL0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX25Q9UHL0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX25Q9UHL0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX25Q9UHL0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX25Q9UHL0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX25Q9UHL0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX25Q9UHL0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX25Q9UHL0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX25Q9UHL0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms