Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SFMBT1Q9UHJ3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SFMBT1Q9UHJ3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SFMBT1Q9UHJ3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SFMBT1Q9UHJ3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SFMBT1Q9UHJ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SFMBT1Q9UHJ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SFMBT1Q9UHJ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SFMBT1Q9UHJ3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SFMBT1Q9UHJ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SFMBT1Q9UHJ3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SFMBT1Q9UHJ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SFMBT1Q9UHJ3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SFMBT1Q9UHJ3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFMBT1Q9UHJ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFMBT1Q9UHJ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFMBT1Q9UHJ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFMBT1Q9UHJ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFMBT1Q9UHJ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFMBT1Q9UHJ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SFMBT1Q9UHJ3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SFMBT1Q9UHJ3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SFMBT1Q9UHJ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SFMBT1Q9UHJ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SFMBT1Q9UHJ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFMBT1Q9UHJ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFMBT1Q9UHJ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFMBT1Q9UHJ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SFMBT1Q9UHJ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SFMBT1Q9UHJ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SFMBT1Q9UHJ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SFMBT1Q9UHJ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SFMBT1Q9UHJ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms