Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ASIC3Q9UHC3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ASIC3Q9UHC3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ASIC3Q9UHC3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms