Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPB1Q9UBR1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPB1Q9UBR1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPB1Q9UBR1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPB1Q9UBR1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPB1Q9UBR1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPB1Q9UBR1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPB1Q9UBR1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPB1Q9UBR1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPB1Q9UBR1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPB1Q9UBR1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPB1Q9UBR1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPB1Q9UBR1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms