Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATXN10Q9UBB4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATXN10Q9UBB4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATXN10Q9UBB4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATXN10Q9UBB4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATXN10Q9UBB4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATXN10Q9UBB4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN10Q9UBB4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATXN10Q9UBB4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATXN10Q9UBB4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATXN10Q9UBB4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATXN10Q9UBB4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATXN10Q9UBB4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATXN10Q9UBB4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN10Q9UBB4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN10Q9UBB4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN10Q9UBB4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN10Q9UBB4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN10Q9UBB4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN10Q9UBB4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN10Q9UBB4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN10Q9UBB4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN10Q9UBB4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN10Q9UBB4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATXN10Q9UBB4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATXN10Q9UBB4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ATXN10Q9UBB4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN10Q9UBB4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms