Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF9Q9P2J2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF9Q9P2J2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF9Q9P2J2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IGSF9Q9P2J2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGSF9Q9P2J2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGSF9Q9P2J2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGSF9Q9P2J2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
IGSF9Q9P2J2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IGSF9Q9P2J2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF9Q9P2J2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF9Q9P2J2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF9Q9P2J2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF9Q9P2J2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF9Q9P2J2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF9Q9P2J2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF9Q9P2J2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF9Q9P2J2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF9Q9P2J2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF9Q9P2J2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF9Q9P2J2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF9Q9P2J2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF9Q9P2J2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF9Q9P2J2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF9Q9P2J2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF9Q9P2J2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF9Q9P2J2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF9Q9P2J2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGSF9Q9P2J2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IGSF9Q9P2J2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF9Q9P2J2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF9Q9P2J2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF9Q9P2J2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF9Q9P2J2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF9Q9P2J2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF9Q9P2J2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF9Q9P2J2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF9Q9P2J2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF9Q9P2J2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF9Q9P2J2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF9Q9P2J2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF9Q9P2J2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF9Q9P2J2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF9Q9P2J2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF9Q9P2J2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF9Q9P2J2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF9Q9P2J2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF9Q9P2J2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF9Q9P2J2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF9Q9P2J2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF9Q9P2J2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF9Q9P2J2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF9Q9P2J2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF9Q9P2J2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms