Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS18Q9P253 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS18Q9P253 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS18Q9P253 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS18Q9P253 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS18Q9P253 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS18Q9P253 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS18Q9P253 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS18Q9P253 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS18Q9P253 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS18Q9P253 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS18Q9P253 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS18Q9P253 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS18Q9P253 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS18Q9P253 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS18Q9P253 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS18Q9P253 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS18Q9P253 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS18Q9P253 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
VPS18Q9P253 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS18Q9P253 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS18Q9P253 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS18Q9P253 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS18Q9P253 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS18Q9P253 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS18Q9P253 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS18Q9P253 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS18Q9P253 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS18Q9P253 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS18Q9P253 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS18Q9P253 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS18Q9P253 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS18Q9P253 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS18Q9P253 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS18Q9P253 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS18Q9P253 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS18Q9P253 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS18Q9P253 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VPS18Q9P253 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS18Q9P253 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS18Q9P253 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS18Q9P253 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS18Q9P253 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS18Q9P253 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS18Q9P253 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS18Q9P253 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS18Q9P253 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS18Q9P253 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS18Q9P253 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS18Q9P253 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS18Q9P253 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms