Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GCNT4Q9P109 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCNT4Q9P109 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCNT4Q9P109 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCNT4Q9P109 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCNT4Q9P109 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCNT4Q9P109 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCNT4Q9P109 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCNT4Q9P109 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCNT4Q9P109 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCNT4Q9P109 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GCNT4Q9P109 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GCNT4Q9P109 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCNT4Q9P109 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCNT4Q9P109 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCNT4Q9P109 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCNT4Q9P109 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCNT4Q9P109 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCNT4Q9P109 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GCNT4Q9P109 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCNT4Q9P109 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCNT4Q9P109 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCNT4Q9P109 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCNT4Q9P109 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCNT4Q9P109 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GCNT4Q9P109 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCNT4Q9P109 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCNT4Q9P109 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCNT4Q9P109 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCNT4Q9P109 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GCNT4Q9P109 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCNT4Q9P109 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCNT4Q9P109 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCNT4Q9P109 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCNT4Q9P109 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCNT4Q9P109 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCNT4Q9P109 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCNT4Q9P109 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCNT4Q9P109 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCNT4Q9P109 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCNT4Q9P109 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GCNT4Q9P109 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCNT4Q9P109 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCNT4Q9P109 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCNT4Q9P109 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GCNT4Q9P109 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms