Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0I2

EMC3, ER membrane protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC3Q9P0I2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMC3Q9P0I2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMC3Q9P0I2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EMC3Q9P0I2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMC3Q9P0I2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMC3Q9P0I2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMC3Q9P0I2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMC3Q9P0I2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMC3Q9P0I2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMC3Q9P0I2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMC3Q9P0I2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC3Q9P0I2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC3Q9P0I2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC3Q9P0I2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC3Q9P0I2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMC3Q9P0I2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMC3Q9P0I2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMC3Q9P0I2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMC3Q9P0I2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMC3Q9P0I2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms