Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU0

FLRT3, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT3, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLRT3Q9NZU0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLRT3Q9NZU0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FLRT3Q9NZU0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FLRT3Q9NZU0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FLRT3Q9NZU0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FLRT3Q9NZU0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FLRT3Q9NZU0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FLRT3Q9NZU0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FLRT3Q9NZU0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FLRT3Q9NZU0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FLRT3Q9NZU0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FLRT3Q9NZU0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FLRT3Q9NZU0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FLRT3Q9NZU0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FLRT3Q9NZU0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FLRT3Q9NZU0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms