Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EHD3Q9NZN3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD3Q9NZN3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD3Q9NZN3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD3Q9NZN3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD3Q9NZN3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD3Q9NZN3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD3Q9NZN3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EHD3Q9NZN3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EHD3Q9NZN3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHD3Q9NZN3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHD3Q9NZN3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHD3Q9NZN3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHD3Q9NZN3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHD3Q9NZN3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD3Q9NZN3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD3Q9NZN3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD3Q9NZN3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD3Q9NZN3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD3Q9NZN3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD3Q9NZN3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD3Q9NZN3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD3Q9NZN3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD3Q9NZN3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EHD3Q9NZN3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EHD3Q9NZN3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EHD3Q9NZN3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD3Q9NZN3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms