Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD3Q9NY59 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMPD3Q9NY59 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMPD3Q9NY59 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD3Q9NY59 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD3Q9NY59 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD3Q9NY59 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD3Q9NY59 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD3Q9NY59 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD3Q9NY59 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD3Q9NY59 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD3Q9NY59 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPD3Q9NY59 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms