Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ING3Q9NXR8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ING3Q9NXR8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ING3Q9NXR8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ING3Q9NXR8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ING3Q9NXR8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ING3Q9NXR8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ING3Q9NXR8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ING3Q9NXR8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ING3Q9NXR8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ING3Q9NXR8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ING3Q9NXR8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms