Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFSP2Q9NUQ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFSP2Q9NUQ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFSP2Q9NUQ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFSP2Q9NUQ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms