Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCM2LQ9NUG4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCM2LQ9NUG4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCM2LQ9NUG4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCM2LQ9NUG4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCM2LQ9NUG4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCM2LQ9NUG4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCM2LQ9NUG4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCM2LQ9NUG4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCM2LQ9NUG4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCM2LQ9NUG4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCM2LQ9NUG4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCM2LQ9NUG4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCM2LQ9NUG4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCM2LQ9NUG4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCM2LQ9NUG4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCM2LQ9NUG4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCM2LQ9NUG4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms