Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPMQ9NSP4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPMQ9NSP4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPMQ9NSP4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPMQ9NSP4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms