Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM7SF3Q9NS93 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM7SF3Q9NS93 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM7SF3Q9NS93 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM7SF3Q9NS93 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM7SF3Q9NS93 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM7SF3Q9NS93 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM7SF3Q9NS93 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM7SF3Q9NS93 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM7SF3Q9NS93 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM7SF3Q9NS93 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM7SF3Q9NS93 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM7SF3Q9NS93 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM7SF3Q9NS93 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM7SF3Q9NS93 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM7SF3Q9NS93 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM7SF3Q9NS93 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM7SF3Q9NS93 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM7SF3Q9NS93 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM7SF3Q9NS93 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM7SF3Q9NS93 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM7SF3Q9NS93 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM7SF3Q9NS93 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM7SF3Q9NS93 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM7SF3Q9NS93 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM7SF3Q9NS93 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM7SF3Q9NS93 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM7SF3Q9NS93 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM7SF3Q9NS93 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM7SF3Q9NS93 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM7SF3Q9NS93 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM7SF3Q9NS93 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TM7SF3Q9NS93 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM7SF3Q9NS93 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM7SF3Q9NS93 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM7SF3Q9NS93 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM7SF3Q9NS93 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM7SF3Q9NS93 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM7SF3Q9NS93 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM7SF3Q9NS93 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM7SF3Q9NS93 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TM7SF3Q9NS93 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM7SF3Q9NS93 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM7SF3Q9NS93 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM7SF3Q9NS93 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM7SF3Q9NS93 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM7SF3Q9NS93 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM7SF3Q9NS93 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM7SF3Q9NS93 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TM7SF3Q9NS93 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms