Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNIP2Q9NS61 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNIP2Q9NS61 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNIP2Q9NS61 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms