Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOPORSQ9NS56 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPORSQ9NS56 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOPORSQ9NS56 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOPORSQ9NS56 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOPORSQ9NS56 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOPORSQ9NS56 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOPORSQ9NS56 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOPORSQ9NS56 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOPORSQ9NS56 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOPORSQ9NS56 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOPORSQ9NS56 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOPORSQ9NS56 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOPORSQ9NS56 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOPORSQ9NS56 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOPORSQ9NS56 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOPORSQ9NS56 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPORSQ9NS56 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPORSQ9NS56 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPORSQ9NS56 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPORSQ9NS56 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPORSQ9NS56 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPORSQ9NS56 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPORSQ9NS56 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPORSQ9NS56 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPORSQ9NS56 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOPORSQ9NS56 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPORSQ9NS56 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPORSQ9NS56 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPORSQ9NS56 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPORSQ9NS56 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPORSQ9NS56 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPORSQ9NS56 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPORSQ9NS56 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPORSQ9NS56 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPORSQ9NS56 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPORSQ9NS56 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPORSQ9NS56 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPORSQ9NS56 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOPORSQ9NS56 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TOPORSQ9NS56 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOPORSQ9NS56 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOPORSQ9NS56 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOPORSQ9NS56 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOPORSQ9NS56 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOPORSQ9NS56 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPORSQ9NS56 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPORSQ9NS56 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOPORSQ9NS56 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPORSQ9NS56 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPORSQ9NS56 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPORSQ9NS56 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPORSQ9NS56 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms