Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF1Q9NS23 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF1Q9NS23 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF1Q9NS23 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASSF1Q9NS23 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RASSF1Q9NS23 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RASSF1Q9NS23 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASSF1Q9NS23 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF1Q9NS23 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF1Q9NS23 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF1Q9NS23 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF1Q9NS23 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF1Q9NS23 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF1Q9NS23 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF1Q9NS23 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF1Q9NS23 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF1Q9NS23 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF1Q9NS23 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF1Q9NS23 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF1Q9NS23 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF1Q9NS23 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF1Q9NS23 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF1Q9NS23 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF1Q9NS23 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASSF1Q9NS23 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RASSF1Q9NS23 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RASSF1Q9NS23 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RASSF1Q9NS23 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RASSF1Q9NS23 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RASSF1Q9NS23 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASSF1Q9NS23 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASSF1Q9NS23 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASSF1Q9NS23 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASSF1Q9NS23 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASSF1Q9NS23 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASSF1Q9NS23 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASSF1Q9NS23 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASSF1Q9NS23 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASSF1Q9NS23 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASSF1Q9NS23 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASSF1Q9NS23 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASSF1Q9NS23 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASSF1Q9NS23 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASSF1Q9NS23 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms