Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX5

NPDC1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPDC1Q9NQX5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPDC1Q9NQX5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPDC1Q9NQX5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPDC1Q9NQX5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPDC1Q9NQX5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPDC1Q9NQX5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPDC1Q9NQX5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPDC1Q9NQX5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPDC1Q9NQX5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPDC1Q9NQX5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPDC1Q9NQX5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPDC1Q9NQX5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPDC1Q9NQX5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPDC1Q9NQX5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPDC1Q9NQX5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPDC1Q9NQX5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPDC1Q9NQX5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPDC1Q9NQX5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPDC1Q9NQX5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPDC1Q9NQX5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPDC1Q9NQX5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPDC1Q9NQX5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPDC1Q9NQX5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPDC1Q9NQX5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPDC1Q9NQX5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPDC1Q9NQX5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPDC1Q9NQX5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPDC1Q9NQX5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPDC1Q9NQX5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPDC1Q9NQX5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPDC1Q9NQX5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPDC1Q9NQX5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPDC1Q9NQX5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPDC1Q9NQX5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPDC1Q9NQX5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms