Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX4

MYO5C, Unconventional myosin-Vc, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5CQ9NQX4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
MYO5CQ9NQX4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC40.46■■■■■ 4.07
MYO5CQ9NQX4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
MYO5CQ9NQX4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
MYO5CQ9NQX4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
MYO5CQ9NQX4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
MYO5CQ9NQX4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
MYO5CQ9NQX4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
MYO5CQ9NQX4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
MYO5CQ9NQX4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
MYO5CQ9NQX4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
MYO5CQ9NQX4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
MYO5CQ9NQX4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
MYO5CQ9NQX4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
MYO5CQ9NQX4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
MYO5CQ9NQX4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
MYO5CQ9NQX4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
MYO5CQ9NQX4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
MYO5CQ9NQX4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
MYO5CQ9NQX4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
MYO5CQ9NQX4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
MYO5CQ9NQX4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC40.35■■■■■ 4.05
MYO5CQ9NQX4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
MYO5CQ9NQX4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
MYO5CQ9NQX4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
MYO5CQ9NQX4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
MYO5CQ9NQX4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
MYO5CQ9NQX4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
MYO5CQ9NQX4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
MYO5CQ9NQX4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
MYO5CQ9NQX4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
MYO5CQ9NQX4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
MYO5CQ9NQX4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
MYO5CQ9NQX4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
MYO5CQ9NQX4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
MYO5CQ9NQX4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
MYO5CQ9NQX4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
MYO5CQ9NQX4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
MYO5CQ9NQX4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
MYO5CQ9NQX4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
MYO5CQ9NQX4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
MYO5CQ9NQX4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
MYO5CQ9NQX4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
MYO5CQ9NQX4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
MYO5CQ9NQX4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
MYO5CQ9NQX4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
MYO5CQ9NQX4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
MYO5CQ9NQX4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
MYO5CQ9NQX4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
MYO5CQ9NQX4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
MYO5CQ9NQX4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
MYO5CQ9NQX4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
MYO5CQ9NQX4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
MYO5CQ9NQX4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
MYO5CQ9NQX4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
MYO5CQ9NQX4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
MYO5CQ9NQX4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
MYO5CQ9NQX4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
MYO5CQ9NQX4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
MYO5CQ9NQX4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
MYO5CQ9NQX4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
MYO5CQ9NQX4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
MYO5CQ9NQX4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
MYO5CQ9NQX4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
MYO5CQ9NQX4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
MYO5CQ9NQX4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
MYO5CQ9NQX4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
MYO5CQ9NQX4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
MYO5CQ9NQX4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
MYO5CQ9NQX4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
MYO5CQ9NQX4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
MYO5CQ9NQX4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
MYO5CQ9NQX4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
MYO5CQ9NQX4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
MYO5CQ9NQX4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
MYO5CQ9NQX4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
MYO5CQ9NQX4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
MYO5CQ9NQX4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
MYO5CQ9NQX4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
MYO5CQ9NQX4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
MYO5CQ9NQX4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
MYO5CQ9NQX4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
MYO5CQ9NQX4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
MYO5CQ9NQX4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
MYO5CQ9NQX4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
MYO5CQ9NQX4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
MYO5CQ9NQX4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
MYO5CQ9NQX4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.02■■■■■ 4
MYO5CQ9NQX4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC40.01■■■■■ 4
MYO5CQ9NQX4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■□ 3.99
MYO5CQ9NQX4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC40■■■■□ 3.99
MYO5CQ9NQX4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
MYO5CQ9NQX4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC40■■■■□ 3.99
MYO5CQ9NQX4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
MYO5CQ9NQX4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
MYO5CQ9NQX4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
MYO5CQ9NQX4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
MYO5CQ9NQX4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
MYO5CQ9NQX4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
MYO5CQ9NQX4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms