Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQE9

HINT3, Histidine triad nucleotide-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINT3Q9NQE9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HINT3Q9NQE9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HINT3Q9NQE9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HINT3Q9NQE9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HINT3Q9NQE9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HINT3Q9NQE9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HINT3Q9NQE9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HINT3Q9NQE9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HINT3Q9NQE9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HINT3Q9NQE9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms