Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MED4Q9NPJ6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MED4Q9NPJ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MED4Q9NPJ6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MED4Q9NPJ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MED4Q9NPJ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MED4Q9NPJ6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MED4Q9NPJ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MED4Q9NPJ6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MED4Q9NPJ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED4Q9NPJ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED4Q9NPJ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED4Q9NPJ6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED4Q9NPJ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED4Q9NPJ6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED4Q9NPJ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MED4Q9NPJ6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MED4Q9NPJ6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MED4Q9NPJ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MED4Q9NPJ6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MED4Q9NPJ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MED4Q9NPJ6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MED4Q9NPJ6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MED4Q9NPJ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MED4Q9NPJ6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MED4Q9NPJ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MED4Q9NPJ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MED4Q9NPJ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MED4Q9NPJ6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MED4Q9NPJ6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MED4Q9NPJ6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MED4Q9NPJ6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MED4Q9NPJ6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms