Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CABP2Q9NPB3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CABP2Q9NPB3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
CABP2Q9NPB3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CABP2Q9NPB3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CABP2Q9NPB3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CABP2Q9NPB3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CABP2Q9NPB3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CABP2Q9NPB3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CABP2Q9NPB3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CABP2Q9NPB3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CABP2Q9NPB3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CABP2Q9NPB3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CABP2Q9NPB3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CABP2Q9NPB3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CABP2Q9NPB3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CABP2Q9NPB3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CABP2Q9NPB3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CABP2Q9NPB3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CABP2Q9NPB3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CABP2Q9NPB3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CABP2Q9NPB3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CABP2Q9NPB3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CABP2Q9NPB3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CABP2Q9NPB3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CABP2Q9NPB3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CABP2Q9NPB3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CABP2Q9NPB3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CABP2Q9NPB3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CABP2Q9NPB3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CABP2Q9NPB3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CABP2Q9NPB3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CABP2Q9NPB3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CABP2Q9NPB3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CABP2Q9NPB3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CABP2Q9NPB3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CABP2Q9NPB3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CABP2Q9NPB3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CABP2Q9NPB3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CABP2Q9NPB3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CABP2Q9NPB3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CABP2Q9NPB3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CABP2Q9NPB3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CABP2Q9NPB3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CABP2Q9NPB3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CABP2Q9NPB3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CABP2Q9NPB3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CABP2Q9NPB3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CABP2Q9NPB3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CABP2Q9NPB3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CABP2Q9NPB3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CABP2Q9NPB3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CABP2Q9NPB3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CABP2Q9NPB3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CABP2Q9NPB3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CABP2Q9NPB3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CABP2Q9NPB3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CABP2Q9NPB3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CABP2Q9NPB3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CABP2Q9NPB3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CABP2Q9NPB3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CABP2Q9NPB3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CABP2Q9NPB3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CABP2Q9NPB3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CABP2Q9NPB3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms