Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB9BQ9NP90 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB9BQ9NP90 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB9BQ9NP90 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB9BQ9NP90 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB9BQ9NP90 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB9BQ9NP90 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB9BQ9NP90 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB9BQ9NP90 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB9BQ9NP90 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB9BQ9NP90 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB9BQ9NP90 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB9BQ9NP90 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB9BQ9NP90 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB9BQ9NP90 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB9BQ9NP90 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB9BQ9NP90 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB9BQ9NP90 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB9BQ9NP90 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms