Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLMQ9NP87 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLMQ9NP87 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLMQ9NP87 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLMQ9NP87 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLMQ9NP87 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLMQ9NP87 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLMQ9NP87 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLMQ9NP87 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POLMQ9NP87 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLMQ9NP87 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLMQ9NP87 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLMQ9NP87 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLMQ9NP87 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLMQ9NP87 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLMQ9NP87 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLMQ9NP87 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLMQ9NP87 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLMQ9NP87 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLMQ9NP87 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
POLMQ9NP87 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLMQ9NP87 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLMQ9NP87 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLMQ9NP87 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLMQ9NP87 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLMQ9NP87 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLMQ9NP87 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLMQ9NP87 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLMQ9NP87 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLMQ9NP87 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLMQ9NP87 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLMQ9NP87 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLMQ9NP87 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLMQ9NP87 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLMQ9NP87 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLMQ9NP87 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLMQ9NP87 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLMQ9NP87 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
POLMQ9NP87 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLMQ9NP87 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
POLMQ9NP87 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLMQ9NP87 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLMQ9NP87 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLMQ9NP87 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLMQ9NP87 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLMQ9NP87 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLMQ9NP87 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLMQ9NP87 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLMQ9NP87 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLMQ9NP87 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLMQ9NP87 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLMQ9NP87 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLMQ9NP87 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLMQ9NP87 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLMQ9NP87 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLMQ9NP87 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLMQ9NP87 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLMQ9NP87 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLMQ9NP87 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POLMQ9NP87 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLMQ9NP87 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLMQ9NP87 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLMQ9NP87 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLMQ9NP87 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLMQ9NP87 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLMQ9NP87 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLMQ9NP87 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLMQ9NP87 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLMQ9NP87 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLMQ9NP87 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms