Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN6

GP6, Platelet glycoprotein VI, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP6Q9HCN6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GP6Q9HCN6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GP6Q9HCN6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GP6Q9HCN6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GP6Q9HCN6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GP6Q9HCN6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GP6Q9HCN6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GP6Q9HCN6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GP6Q9HCN6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GP6Q9HCN6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GP6Q9HCN6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GP6Q9HCN6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GP6Q9HCN6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GP6Q9HCN6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GP6Q9HCN6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GP6Q9HCN6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GP6Q9HCN6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GP6Q9HCN6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GP6Q9HCN6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GP6Q9HCN6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GP6Q9HCN6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GP6Q9HCN6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GP6Q9HCN6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GP6Q9HCN6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GP6Q9HCN6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GP6Q9HCN6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GP6Q9HCN6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GP6Q9HCN6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GP6Q9HCN6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GP6Q9HCN6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GP6Q9HCN6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GP6Q9HCN6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GP6Q9HCN6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms