Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CENPJQ9HC77 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CENPJQ9HC77 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CENPJQ9HC77 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CENPJQ9HC77 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CENPJQ9HC77 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CENPJQ9HC77 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CENPJQ9HC77 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CENPJQ9HC77 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CENPJQ9HC77 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CENPJQ9HC77 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CENPJQ9HC77 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CENPJQ9HC77 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CENPJQ9HC77 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CENPJQ9HC77 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CENPJQ9HC77 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CENPJQ9HC77 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CENPJQ9HC77 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CENPJQ9HC77 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CENPJQ9HC77 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CENPJQ9HC77 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CENPJQ9HC77 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CENPJQ9HC77 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CENPJQ9HC77 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CENPJQ9HC77 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CENPJQ9HC77 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CENPJQ9HC77 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
CENPJQ9HC77 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CENPJQ9HC77 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CENPJQ9HC77 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CENPJQ9HC77 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CENPJQ9HC77 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CENPJQ9HC77 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CENPJQ9HC77 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CENPJQ9HC77 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CENPJQ9HC77 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CENPJQ9HC77 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CENPJQ9HC77 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CENPJQ9HC77 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CENPJQ9HC77 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CENPJQ9HC77 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CENPJQ9HC77 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CENPJQ9HC77 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CENPJQ9HC77 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CENPJQ9HC77 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CENPJQ9HC77 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CENPJQ9HC77 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CENPJQ9HC77 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CENPJQ9HC77 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CENPJQ9HC77 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CENPJQ9HC77 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CENPJQ9HC77 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CENPJQ9HC77 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CENPJQ9HC77 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CENPJQ9HC77 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CENPJQ9HC77 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CENPJQ9HC77 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
CENPJQ9HC77 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CENPJQ9HC77 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CENPJQ9HC77 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CENPJQ9HC77 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CENPJQ9HC77 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CENPJQ9HC77 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CENPJQ9HC77 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CENPJQ9HC77 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CENPJQ9HC77 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CENPJQ9HC77 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CENPJQ9HC77 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CENPJQ9HC77 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CENPJQ9HC77 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CENPJQ9HC77 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CENPJQ9HC77 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CENPJQ9HC77 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms