Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC28A3Q9HAS3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC28A3Q9HAS3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC28A3Q9HAS3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC28A3Q9HAS3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC28A3Q9HAS3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC28A3Q9HAS3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC28A3Q9HAS3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC28A3Q9HAS3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC28A3Q9HAS3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC28A3Q9HAS3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC28A3Q9HAS3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC28A3Q9HAS3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC28A3Q9HAS3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLC28A3Q9HAS3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC28A3Q9HAS3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC28A3Q9HAS3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC28A3Q9HAS3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC28A3Q9HAS3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC28A3Q9HAS3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC28A3Q9HAS3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC28A3Q9HAS3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC28A3Q9HAS3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC28A3Q9HAS3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC28A3Q9HAS3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC28A3Q9HAS3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC28A3Q9HAS3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC28A3Q9HAS3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC28A3Q9HAS3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC28A3Q9HAS3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC28A3Q9HAS3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC28A3Q9HAS3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC28A3Q9HAS3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC28A3Q9HAS3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC28A3Q9HAS3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC28A3Q9HAS3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC28A3Q9HAS3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC28A3Q9HAS3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC28A3Q9HAS3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC28A3Q9HAS3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC28A3Q9HAS3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC28A3Q9HAS3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC28A3Q9HAS3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC28A3Q9HAS3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC28A3Q9HAS3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC28A3Q9HAS3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC28A3Q9HAS3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC28A3Q9HAS3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC28A3Q9HAS3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC28A3Q9HAS3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC28A3Q9HAS3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC28A3Q9HAS3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC28A3Q9HAS3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC28A3Q9HAS3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC28A3Q9HAS3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC28A3Q9HAS3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC28A3Q9HAS3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC28A3Q9HAS3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC28A3Q9HAS3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC28A3Q9HAS3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC28A3Q9HAS3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC28A3Q9HAS3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC28A3Q9HAS3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC28A3Q9HAS3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC28A3Q9HAS3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC28A3Q9HAS3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC28A3Q9HAS3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC28A3Q9HAS3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC28A3Q9HAS3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC28A3Q9HAS3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC28A3Q9HAS3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC28A3Q9HAS3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC28A3Q9HAS3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC28A3Q9HAS3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC28A3Q9HAS3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC28A3Q9HAS3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC28A3Q9HAS3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC28A3Q9HAS3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC28A3Q9HAS3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC28A3Q9HAS3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms