Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLRE1BQ9H816 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCLRE1BQ9H816 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCLRE1BQ9H816 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCLRE1BQ9H816 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCLRE1BQ9H816 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DCLRE1BQ9H816 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLRE1BQ9H816 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCLRE1BQ9H816 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCLRE1BQ9H816 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCLRE1BQ9H816 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCLRE1BQ9H816 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLRE1BQ9H816 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLRE1BQ9H816 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLRE1BQ9H816 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCLRE1BQ9H816 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCLRE1BQ9H816 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCLRE1BQ9H816 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCLRE1BQ9H816 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCLRE1BQ9H816 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCLRE1BQ9H816 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCLRE1BQ9H816 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCLRE1BQ9H816 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCLRE1BQ9H816 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLRE1BQ9H816 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLRE1BQ9H816 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLRE1BQ9H816 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DCLRE1BQ9H816 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCLRE1BQ9H816 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DCLRE1BQ9H816 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DCLRE1BQ9H816 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DCLRE1BQ9H816 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DCLRE1BQ9H816 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLRE1BQ9H816 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLRE1BQ9H816 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLRE1BQ9H816 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms