Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NRDE2Q9H7Z3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRDE2Q9H7Z3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NRDE2Q9H7Z3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NRDE2Q9H7Z3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRDE2Q9H7Z3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRDE2Q9H7Z3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRDE2Q9H7Z3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRDE2Q9H7Z3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRDE2Q9H7Z3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRDE2Q9H7Z3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRDE2Q9H7Z3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NRDE2Q9H7Z3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRDE2Q9H7Z3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRDE2Q9H7Z3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NRDE2Q9H7Z3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NRDE2Q9H7Z3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NRDE2Q9H7Z3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRDE2Q9H7Z3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRDE2Q9H7Z3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NRDE2Q9H7Z3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRDE2Q9H7Z3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRDE2Q9H7Z3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 772.2 ms