Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCAS3Q9H6U6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCAS3Q9H6U6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
BCAS3Q9H6U6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCAS3Q9H6U6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
BCAS3Q9H6U6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCAS3Q9H6U6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCAS3Q9H6U6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCAS3Q9H6U6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCAS3Q9H6U6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCAS3Q9H6U6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCAS3Q9H6U6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCAS3Q9H6U6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCAS3Q9H6U6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCAS3Q9H6U6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCAS3Q9H6U6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCAS3Q9H6U6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCAS3Q9H6U6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCAS3Q9H6U6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCAS3Q9H6U6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCAS3Q9H6U6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCAS3Q9H6U6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCAS3Q9H6U6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
BCAS3Q9H6U6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCAS3Q9H6U6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCAS3Q9H6U6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCAS3Q9H6U6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCAS3Q9H6U6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCAS3Q9H6U6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCAS3Q9H6U6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCAS3Q9H6U6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCAS3Q9H6U6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCAS3Q9H6U6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCAS3Q9H6U6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCAS3Q9H6U6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCAS3Q9H6U6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCAS3Q9H6U6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
BCAS3Q9H6U6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
BCAS3Q9H6U6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms