Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C11orf49Q9H6J7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C11orf49Q9H6J7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C11orf49Q9H6J7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C11orf49Q9H6J7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C11orf49Q9H6J7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
C11orf49Q9H6J7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
C11orf49Q9H6J7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
C11orf49Q9H6J7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
C11orf49Q9H6J7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
C11orf49Q9H6J7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C11orf49Q9H6J7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C11orf49Q9H6J7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C11orf49Q9H6J7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C11orf49Q9H6J7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C11orf49Q9H6J7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C11orf49Q9H6J7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C11orf49Q9H6J7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C11orf49Q9H6J7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
C11orf49Q9H6J7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
C11orf49Q9H6J7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
C11orf49Q9H6J7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
C11orf49Q9H6J7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
C11orf49Q9H6J7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
C11orf49Q9H6J7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
C11orf49Q9H6J7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C11orf49Q9H6J7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C11orf49Q9H6J7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
C11orf49Q9H6J7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C11orf49Q9H6J7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C11orf49Q9H6J7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C11orf49Q9H6J7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C11orf49Q9H6J7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C11orf49Q9H6J7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
C11orf49Q9H6J7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
C11orf49Q9H6J7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
C11orf49Q9H6J7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
C11orf49Q9H6J7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C11orf49Q9H6J7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C11orf49Q9H6J7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C11orf49Q9H6J7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C11orf49Q9H6J7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
C11orf49Q9H6J7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C11orf49Q9H6J7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C11orf49Q9H6J7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
C11orf49Q9H6J7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C11orf49Q9H6J7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C11orf49Q9H6J7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C11orf49Q9H6J7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C11orf49Q9H6J7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C11orf49Q9H6J7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C11orf49Q9H6J7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
C11orf49Q9H6J7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C11orf49Q9H6J7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
C11orf49Q9H6J7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C11orf49Q9H6J7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C11orf49Q9H6J7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C11orf49Q9H6J7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C11orf49Q9H6J7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C11orf49Q9H6J7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C11orf49Q9H6J7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C11orf49Q9H6J7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
C11orf49Q9H6J7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
C11orf49Q9H6J7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
C11orf49Q9H6J7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
C11orf49Q9H6J7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms