Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRN3Q9H3W5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRN3Q9H3W5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRN3Q9H3W5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRN3Q9H3W5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRN3Q9H3W5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRN3Q9H3W5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRN3Q9H3W5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRN3Q9H3W5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRN3Q9H3W5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRN3Q9H3W5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRN3Q9H3W5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRN3Q9H3W5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRN3Q9H3W5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRN3Q9H3W5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRN3Q9H3W5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRN3Q9H3W5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRN3Q9H3W5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRN3Q9H3W5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRN3Q9H3W5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRN3Q9H3W5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRN3Q9H3W5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRN3Q9H3W5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRN3Q9H3W5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRN3Q9H3W5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRN3Q9H3W5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRN3Q9H3W5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRN3Q9H3W5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRN3Q9H3W5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRN3Q9H3W5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRN3Q9H3W5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRN3Q9H3W5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRN3Q9H3W5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRN3Q9H3W5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRN3Q9H3W5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRN3Q9H3W5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRN3Q9H3W5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms