Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCX3BQ9H321 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCX3BQ9H321 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCX3BQ9H321 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCX3BQ9H321 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCX3BQ9H321 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCX3BQ9H321 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCX3BQ9H321 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCX3BQ9H321 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCX3BQ9H321 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCX3BQ9H321 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCX3BQ9H321 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCX3BQ9H321 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCX3BQ9H321 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCX3BQ9H321 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCX3BQ9H321 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCX3BQ9H321 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCX3BQ9H321 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCX3BQ9H321 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCX3BQ9H321 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCX3BQ9H321 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCX3BQ9H321 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCX3BQ9H321 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCX3BQ9H321 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VCX3BQ9H321 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms