Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2Y9

SLCO5A1, Solute carrier organic anion transporter family member 5A1, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO5A1Q9H2Y9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLCO5A1Q9H2Y9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLCO5A1Q9H2Y9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLCO5A1Q9H2Y9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLCO5A1Q9H2Y9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO5A1Q9H2Y9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO5A1Q9H2Y9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO5A1Q9H2Y9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms