Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHACTR1Q9C0D0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHACTR1Q9C0D0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR1Q9C0D0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHACTR1Q9C0D0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PHACTR1Q9C0D0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHACTR1Q9C0D0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHACTR1Q9C0D0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHACTR1Q9C0D0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR1Q9C0D0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR1Q9C0D0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR1Q9C0D0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms