Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 ARFRP1-204ENST00000609537 593 ntTSL 316.6■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 MRPS24-204ENST00000467084 729 ntTSL 216.3■□□□□ 0.23e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.113e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 MRPS24-205ENST00000483330 392 ntTSL 214.73□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 PDHX-202ENST00000430469 952 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 PDHX-208ENST00000533550 584 ntTSL 49.08□□□□□ -0.963e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 CCDC57-207ENST00000419322 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.78■□□□□ 0.444e-7■■■■■ 31.3
FTOQ9C0B1 CCDC57-214ENST00000582040 330 ntTSL 316.73■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 31.3
FTOQ9C0B1 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 31.3
FTOQ9C0B1 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 31.3
FTOQ9C0B1 CCDC57-205ENST00000392346 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.214e-7■■■■■ 31.3
FTOQ9C0B1 SRSF6-202ENST00000483871 1680 ntTSL 216.08■□□□□ 0.161e-10■■■■■ 31.2
FTOQ9C0B1 SRSF6-201ENST00000244020 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.691e-10■■■■■ 31.2
FTOQ9C0B1 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.617e-8■■■■■ 31.1
FTOQ9C0B1 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.387e-8■■■■■ 31.1
FTOQ9C0B1 TSPAN17-205ENST00000504168 884 ntTSL 527.26■■□□□ 1.954e-8■■■■■ 31.1
FTOQ9C0B1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.784e-8■■■■■ 31.1
FTOQ9C0B1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.654e-8■■■■■ 31.1
FTOQ9C0B1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.324e-8■■■■■ 31.1
FTOQ9C0B1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.954e-8■■■■■ 31.1
FTOQ9C0B1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.754e-8■■■■■ 31.1
FTOQ9C0B1 TSPAN17-203ENST00000503030 909 ntTSL 318.84■□□□□ 0.614e-8■■■■■ 31.1
FTOQ9C0B1 TSPAN17-206ENST00000507471 707 ntTSL 316.28■□□□□ 0.24e-8■■■■■ 31.1
FTOQ9C0B1 TSPAN17-208ENST00000514705 4445 ntTSL 216.16■□□□□ 0.184e-8■■■■■ 31.1
FTOQ9C0B1 NCAPG2-210ENST00000491792 581 ntTSL 313.88□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 30.9
FTOQ9C0B1 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 30.9
FTOQ9C0B1 NCAPG2-207ENST00000472591 554 ntTSL 412.4□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 30.9
FTOQ9C0B1 NCAPG2-203ENST00000409423 3957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 30.9
FTOQ9C0B1 NCAPG2-206ENST00000467785 3276 ntTSL 1 (best)9.88□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 30.9
FTOQ9C0B1 NCAPG2-205ENST00000441982 2926 ntTSL 29.66□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 30.9
FTOQ9C0B1 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 59.58□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 30.9
FTOQ9C0B1 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 30.9
FTOQ9C0B1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.631e-6■■■■■ 30.8
FTOQ9C0B1 DPH7-210ENST00000479650 1797 ntTSL 521.41■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 30.8
FTOQ9C0B1 DPH7-207ENST00000475100 919 ntTSL 319.34■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 30.8
FTOQ9C0B1 DPH7-206ENST00000472113 1414 ntTSL 517.67■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 30.8
FTOQ9C0B1 DPH7-212ENST00000485189 797 ntTSL 317.23■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 30.8
FTOQ9C0B1 DPH7-204ENST00000467768 750 ntTSL 516.4■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 30.8
FTOQ9C0B1 DPH7-209ENST00000477690 1220 ntTSL 316.33■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 30.8
FTOQ9C0B1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.21e-6■■■■■ 30.7
FTOQ9C0B1 ATP8B2-203ENST00000368490 473 ntTSL 326.46■■□□□ 1.831e-6■■■■■ 30.7
FTOQ9C0B1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31e-8■■■■■ 30.7
FTOQ9C0B1 SREBF1-216ENST00000490796 698 ntTSL 222.9■■□□□ 1.261e-6■■■■■ 30.7
FTOQ9C0B1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.231e-8■■■■■ 30.7
FTOQ9C0B1 SREBF1-204ENST00000395756 3026 ntTSL 221.08■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 30.7
FTOQ9C0B1 TMEM8A-208ENST00000476735 801 ntTSL 520.19■□□□□ 0.821e-8■■■■■ 30.7
FTOQ9C0B1 SREBF1-203ENST00000395751 4653 ntTSL 218.82■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 30.7
FTOQ9C0B1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 30.7
FTOQ9C0B1 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 30.7
FTOQ9C0B1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 30.7
FTOQ9C0B1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 30.7
FTOQ9C0B1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 30.7
FTOQ9C0B1 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 30.7
FTOQ9C0B1 SREBF1-207ENST00000447641 644 ntTSL 315.78■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 30.7
FTOQ9C0B1 SREBF1-223ENST00000584760 564 ntTSL 215.18■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 30.7
FTOQ9C0B1 TMEM8A-203ENST00000427313 587 ntTSL 414.29□□□□□ -0.121e-8■■■■■ 30.7
FTOQ9C0B1 AL117329.1-201ENST00000423737 1815 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 30.7
FTOQ9C0B1 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 216.29■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 30.6
FTOQ9C0B1 SS18L1-203ENST00000450482 781 ntTSL 513.56□□□□□ -0.243e-9■■■■■ 30.4
FTOQ9C0B1 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.673e-9■■■■■ 30.4
FTOQ9C0B1 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 319.63■□□□□ 0.731e-8■■■■■ 30.4
FTOQ9C0B1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.276e-7■■■■■ 30.4
FTOQ9C0B1 FOXN3-211ENST00000555855 851 ntTSL 522.85■■□□□ 1.256e-7■■■■■ 30.4
FTOQ9C0B1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.246e-7■■■■■ 30.4
FTOQ9C0B1 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.86e-7■■■■■ 30.4
FTOQ9C0B1 C1orf159-213ENST00000472741 661 ntTSL 421.15■□□□□ 0.989e-8■■■■■ 30.1
FTOQ9C0B1 C1orf159-217ENST00000480643 579 ntTSL 417.44■□□□□ 0.389e-8■■■■■ 30.1
FTOQ9C0B1 PPP1R12C-203ENST00000586197 472 ntTSL 517.79■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 29.9
FTOQ9C0B1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.081e-9■■■■■ 29.9
FTOQ9C0B1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.859e-12■■■■■ 29.8
FTOQ9C0B1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.789e-12■■■■■ 29.8
FTOQ9C0B1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.792e-16■■■■■ 29.6
FTOQ9C0B1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.532e-16■■■■■ 29.6
FTOQ9C0B1 TSEN15-206ENST00000485209 806 ntTSL 324.34■■□□□ 1.492e-16■■■■■ 29.6
FTOQ9C0B1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.272e-16■■■■■ 29.6
FTOQ9C0B1 TSEN15-205ENST00000462677 1628 ntTSL 1 (best)22.54■■□□□ 1.22e-16■■■■■ 29.6
FTOQ9C0B1 TSEN15-202ENST00000367518 573 ntTSL 321.88■■□□□ 1.092e-16■■■■■ 29.6
FTOQ9C0B1 SENP6-211ENST00000493959 867 ntTSL 326■■□□□ 1.751e-11■■■■■ 29.6
FTOQ9C0B1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.21e-11■■■■■ 29.6
FTOQ9C0B1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.911e-11■■■■■ 29.6
FTOQ9C0B1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.491e-11■■■■■ 29.6
FTOQ9C0B1 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.222e-7■■■■■ 29.6
FTOQ9C0B1 CANX-208ENST00000504579 533 ntTSL 426.47■■□□□ 1.837e-22■■■■■ 29.6
FTOQ9C0B1 CANX-212ENST00000506654 592 ntTSL 326.47■■□□□ 1.837e-22■■■■■ 29.6
FTOQ9C0B1 CANX-204ENST00000502498 570 ntTSL 421.23■□□□□ 0.997e-22■■■■■ 29.6
FTOQ9C0B1 CANX-219ENST00000514383 585 ntTSL 320.19■□□□□ 0.827e-22■■■■■ 29.6
FTOQ9C0B1 CANX-216ENST00000510810 511 ntTSL 418.25■□□□□ 0.517e-22■■■■■ 29.6
FTOQ9C0B1 CANX-203ENST00000502296 825 ntTSL 418■□□□□ 0.477e-22■■■■■ 29.6
FTOQ9C0B1 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.399e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 ATXN7L3-205ENST00000587097 1341 ntTSL 534.86■■■■□ 3.179e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 D2HGDH-214ENST00000473126 1612 ntTSL 1 (best)28.1■■■□□ 2.099e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 D2HGDH-215ENST00000486953 2232 ntTSL 1 (best)27.41■■□□□ 1.989e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.959e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 D2HGDH-212ENST00000468064 2298 ntTSL 1 (best)26.54■■□□□ 1.849e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 D2HGDH-202ENST00000400769 2277 ntTSL 226.54■■□□□ 1.849e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 TFG-205ENST00000479672 776 ntTSL 326.54■■□□□ 1.849e-7■■■■■ 29.5
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